К середине ХIX века все церкви Логойска одряхлели и было принято решение построить вместо всех деревянных церквей один каменный храм. Местом для храма была выбрана гора, на которой издавна стояла Пречистенская церковь. Новый храм был построен в 1862-66 годах на государственные средства и освящен во имя святого Николая. 8 сентября 1907 года в храм была торжественно внесена древняя икона Логойской Божией Матери, которая до этого принадлежала униатскому монастырю, а с его упразднением попала в частную коллекцию.

Памятник ретроспективно-русского стиля. Объёмно-просторная композиция храма складывается из прямоугольного в плане основного объёма, пятигранной апсиды с низкими боковыми ризницами, трехъярусной колокольни над притвором, невысокой трапезной. Фасады украшены крупными лопатками, опоясаны карнизами. Высокие арочные оконный проемы расположены в два яруса, декорированы профилированными рамами.

В 80-е годы усилиями местного священника Владимира Зимницкого храм был расписан приглашенными из Сергиева Посада художниками во главе с А.Г.Столяровым. Роспись алтаря сделана на тему Тайная Вечеря, а храма — на тему Апокалипсис.