Изначально — чешский торговый городок, затем (с 1252 года) — владение Тевтонского ордена (в этот период Хомутов был полностью германизирован). В 1396 году получил права города, а в 1416 — был продан Вацлаву IV, императору Священной Римской империи. 16 марта 1421 года город был разрушен таборитами, а в 1588 здесь водворились иезуиты. В 1605 году стал королевским свободным городом. Во время Тридцатилетней войны дважды был занят шведами — в 1645 и в 1647 годах.

Основные достопримечательности Хомутова — готические церкви Святого Игната и Святой Екатерины, а также краеведческий музей.