На месте современного города издавна существовало селение — Богучарский юрт. В 1704 году был известен как казачий поселок.

В 1716 году по берегам рек Толучеевка и Богучар (называлась Баучар или Боучар) были поселены 200 черкасов (казаки-малороссы по происхождению) Острогожского полка, образовалась Богучарская слобода. Позже название реки превращается в Богучар (ныне Богучарка). От гидронима в форме "Богучар" получил название город. Считая исходным вариант "Боучар", можно предполагать на основе гидронима "буча", "бучало", что в воронежских говорах "глубокая яма на дне реки, омут, водоворот на реке".

В 1717 году переселено еще несколько сотен казаков того же полка.

В 1765 году Богучарская слобода вошла в состав Острогожской провинции Слободско-Украинской губернии. Уездный город Богучар Воронежского наместничества с 1779 года. В 1802 году причислен к Воронежской губернии.

Основными занятиями населения были земледелие, закупка скота в областях войска Донского и отправка его в столичные города.

Реликтовые озера, девственная ковыльная степь, урочища байрачного леса, огромные залежи гранита — далеко не полный перечень природных богатств района. На территории района имеется уникальный Белогорский источник минеральной воды, которая по своему химическому составу и бальнеологическим свойствам является единственной в РФ и второй в мире: она содержит в исключительно благоприятном соотношении йод, бром, литий, мышьяк, стронций, борную кислоту, хлористый натрий и хлористый кальций.

Хрипунская степь, или Байбаковский заповедник, находится в Богучарском районе, в 5 километрах к югу от села Новоникольского (бывший Хрипун) на границе с Ростовской областью. Заповедная степь и окружающие ее старые залежи на водоразделе имеют площадь 67 гектаров, почва — обыкновенный чернозем. Хрипунская степь — последний и единственный в Центральном Черноземье сохранившийся в зональных условиях ландшафт разнотравно-типчаково-ковыльных степей.

Древесный питомник расположен близ с. Подколодновки, на левом берегу Дона. Существует на базе бывшего питомника "Агролес", возникшего в 1930-е годы. В насаждениях и коллекциях питомника насчитывается свыше 40 видов деревьев и кустарников, в своем большинстве экзотов. Среди последних — плодоносящие посадки сосен Банкса, черной и жесткой (дает стволовую и пневую поросль), амурского пробкового дерева, ясеня зеленого и пушистого, гледачии трехколючковой, катальпы сиренелистной, шелковицы белой и других.

Минеральный источник "Белая горка" действует в Богучарском районе у хутора одноименного названия, расположенного в 50 километрах от города Богучар и в 4 километрах от села Сухой Донец. Источник открыт в 1931 году академиком А.А.Дубянским. Вода его поступает со 156-метровой глубины. Температура воды и зимой, и летом постоянная: +19 С. Дебит достаточно высокий — 4 л/с: ведро наполняется за считанные секунды, и живая вода по желобу стекает в реку Дон. Большая сила заключена в белогорской воде. По своим свойствам она целебная. Анализы показывают, что в состав воды входит много химических элементов. Воду сравнивают с трускавецкой и карловарской.