Время основания неизвестно, существовал уже в XVI веке. Название берёт от главной святыни монастыря — чудотворной иконы святителя Николая.

В начале XVII века разорён поляками. Возобновлён в 1711 году. В том же году построен сохранившийся до нашего времени Никольский храм. В начале XX век здесь были игумен, 9 монахов и 10 послушников. Возвращён церкви в 1996 году, возобновлён как женский. Постоянные насельницы появились в 1999 году.

В монастыре 5 действующих храмов, среди них: деревянный, в стиле северного зодчества, храм преподобного Сергия Радонежского и «пещерный» храм преподобных Антония и Феодосия Киево-печерских. Ведётся строительство 4-х храмов, в том числе: верхнего — в честь преподобного Сергия Радонежского и нижнего — в честь преподобных Антония и Феодосия Киево-печерских.