До конца XVII века аптекарское дело в Киеве отсутствовало. Впервые намерение открыть аптеку упоминается в письме генерала Патрика Гордона в 1685 году царице Софье Алексеевне. Генерал называл открытие аптеки одним из условий, на которых он согласен оставаться в Киеве. Но это требование так и осталось не выполненным.

Открылась первая аптека при киевском губернаторе князе Дмитрии Голицыне. Он обратился к Всероссийскому Самодержцу Императору Петру Великому с «докладными пунктами», предложив: «Для лучшей пользы солдат в Киеве следует устроить аптеку, и при ней быть доктору и аптекарю». 18 февраля 1715 года вышел Высочайший указ, повелевающий выполнить эту просьбу. Так в Киеве появилась казённая аптека от Аптекарского приказа, который ведал медико-санитарным обеспечением армии, подбором и распределением штата полковых лекарей, подготовкой отечественных медицинских кадров и принимал участие в разработке мероприятий по борьбе с эпидемиями чумы и холеры.

В 1728 году, через 13 лет после создания в Киеве первой казенной аптеки для солдат Государь Император Петр I жаловал право на открытие партикулярной (частной) аптеки немецкому колонисту Иоганну Гейтеру, который был призван в войско в Украину, где заведовал производным врачебным составом. Освободившись от службы и осев в Киеве в 1727 году Иоганн Гейтер решил открыть на собственные деньги фармацию, о чем написал в письмах к гетману Даниилу Апостолу и в медицинскую канцелярию. В 1730 году между Фроловским и Петропавловским монастырями, была открыта первая партикулярная аптека, которая до 1770-х годов оставалась единственной частной аптекой в Киеве.

Подробнее о лекарствах, эпидемии чумы в Киеве и последующих владельцах аптеки Бунге и Тецнеровых.

С 1986 года действует аптека-музей с любопытной экспозицией, отражающей историю киевской фармакологии.