Больничная церковь святого Войцеха была построена на северо-восточной окраине исторического центра Люблина, при госпитале святого Лазаря и окружена большим парком. Первый храм, возведенный в 1610 году, был выполнен из дерева. Ренессансная церковь, которую мы видим сейчас, была заложена в 1630 году.

Несколько веков храм исправно служил для проведения месс. Больница святого Лазаря, которой управляли монахини ордена святого Франциска, работала до начала XIX века. Затем на ее содержание стало не хватать средств, и все монастырское имущество, а также святые постройки, в том числе и костел святого Войцеха, были проданы на открытом аукционе. Почти все хозяйство приобрела еврейская община, которая превратила местный госпиталь в некое подобие общежития. Так как храм святого Войцеха был уже не нужен, то в его здании организовали склад для хранения железа. Так продолжалось до 1920 года, пока и бывший госпиталь святого Лазаря, и церковь при нем не купила епархия Люблина. До 1937 года тут обитали братья Святого Креста, а после госпиталь принадлежал сестрам милосердия, которые устроили тут школу-интернат для девочек. В настоящее время все постройки принадлежат сестрам ордена святого Франциска Серафимского. В нескольких помещениях бывшего госпиталя открыт Епархиальный музей, еще пара комнат отведены под детский сад.

Однонефный храм святого Войцеха в XIX веке утратил все свое оригинальное внутреннее убранство. Три алтаря, которые мы можем увидеть в этом костеле, были привезены сюда из замковой часовни святой Троицы в 1954 году. Один из них, изготовленный в 1610 году, посвящен Деве Марии. На втором можно увидеть изображение святого Антония, на третьем — Распятие. К достопримечательностям церкви относятся также фрески с образами покровителя храма святого Войцеха и Святой Троицы. Они сохранились на хорах костела.