Город расположен на левом берегу Волги, в 40 километрах от Углича и в 42 километрах от Рыбинска. Шоссейные дороги связывают Мышкин с Москвой (260 км) и Ярославлем (92 км), а посредством автобусной связи город соединен с железнодорожной станцией «Волга», расположенной в 22 километрах от города. В Мышкине находится пристань, где останавливаются круизные теплоходы и паромы.

Этимология города происходит от имени Мышка и восходит к легенде о князе, спасенном мышью от змеи.

Первое упоминание о Мышкине относится к XV веку, в этот период поселение относятся к владениям князей Ушатых. Статус города и соответственно герб приобретены Мышкиным в 1777 году. На гербе города и по сей день изображен медведь на серебряном фоне (вверху герба), а ниже на красном фоне — мышь. В тот период сельский облик Мышкина был украшен несколькими каменными постройками — Никольским собором, Алексеевской церковью, зданием присутственных мест, торговых рядов и несколькими частными домами, а количество жителей города не превышало и 700 человек. В XIX веке — город центр торговли маслом и прочими продуктами, а также льном.

Современный Мышкин внесен в состав городов Золотого кольца России. Его главным достоянием можно считать старинный облик и природно-ландшафтную уникальность — ведь Мышкин возведен на шести холмах и вплотную окружен сосновыми лесами.

Мышкин — туристический город с уникальными достопримечательностями. Развитие туризма в городе началось в 1996 году, с проведением всероссийского фестиваля «Мышь-96». В городе кроме этого фестиваля проходит «Олимпиада смеха» и фестиваль «Русские валенки». В мышкинском районе развивается и сельский туризм, например в селах Мартыново и Учма были созданы краеведческие музеи, экспозиции которых повествуют об истории и жизни сел.

Для обслуживания потока туристов в городе Мышкин функционирует несколько гостиниц, в частности "Саммит", "Весна", "Кошкин дом", "Мышкино подворье".

В городе работает музейное образование «Мышкинский Народный музей», которое объединяет пять музеев: Музей мыши, Историко-этнографический музей под открытым небом, Музей уникальной техники (автомобилей, мотоциклов, мотороллеров, катеров, спецтехники, коллекцию старинных саней), Музей столицы лоцманов и Музей Петра Смирнова. А все современные здания Мышкина вынесены за пределы старого города.

Кроме этих музеев следует посетить музей льна и русского валенка, а также школу прикладного искусства, при которой находится гончарная мастерская. В ней каждый может изготовить гончарное изделие и расписать его.